Archéologue, numismate, botaniste et minéralogiste, il fonde en 1792 le Magasin
encyclopédique, ou Journal des sciences, des lettres et des arts, qui a tenu le rôle du
Journal des savants pendant l’interruption de sa publication. Millin est emprisonné en 1793 en raison de sa lutte contre les Jacobins et sa rédaction de la Chronique de Paris. Après un an de prison, il part enseigner l'archéologie à la Bibliothèque nationale, à Paris, où il fut conservateur-professeur du département des antiquités. Puis, il est le successeur de l’abbé Barthélemy au cabinet des Médailles en 1795. Il est élu président du
Conservatoire le 26 vendémiaire an VIII.