Faisant suite aux Archives Ancien Régime, le fonds intitulé Archives Modernes couvre la période révolutionnaire, le XIXe siècle et pour certains dossiers les premières années du XXe siècle. Il est composé de près de 750 registres, cahiers, liasses et fichiers concernant l’ensemble de l’établissement, mais il est particulièrement riche pour le département des Manuscrits, dont les archives particulières ont été intégrées dans la série générale. Le classement adopté suit autant qu’il est possible celui des Archives Ancien Régime : budget, dépenses et recettes générales, administration, bâtiments et personnel, acquisitions, reliure. Les Archives Modernes contiennent aussi des informations sur diverses collections et une correspondance particulièrement volumineuse, classée de façon plus structurée que pour la période précédente, et de nouvelles rubriques apparaissent : procès-verbaux du Conservatoire (An IV-1922), dépôt légal, prêt, organisation et règlement intérieurs... De nombreux rapports touchant à tous les aspects de la vie de l’institution et des papiers de travail consacrés à ces sujets, notamment de Van Praet et de Léopold Delisle, viennent compléter les documents à caractère purement administratif.
Laffitte, Marie-Pierre. Archives Modernes, Révolution, XIXe siècle, début du XXe siècle, inventaire sommaire et index, 1983, dactylographie corrigée et complétée en 2000, 48 p. Cet inventaire est régulièrement enrichi par l’insertion de notices plus développées ou l’addition de nouveaux numéros. Il est donc préférable d’en consulter une version récente.